Resolved questions
A diferença destas orações é a conjugação do verbo. Então faz diferenças entre as 2?

Antes de mais nada: Telefone não SONHA. (SONHAR = to dream). Você possivelmente deve estar confundindo com o espanhol SUENA. Em espanhol se usa o verbo SONAR para telefones, mas ele não faz sentido no português. Em português, o telefone TOCA (verbo TOCAR). Vamos refazer seus exemplos:

1 Me incomoda ter que interromper o trabalho cada vez que TOCA o telefone.
2 Me incomoda ter que interromper o trabalho cada vez que TOCAR o telefone.

Sim, tem diferença.

A primeira indica uma coisa que te incomoda sempre, constantemente. Você não gosta de interromper seu trabalho para atender o telefone.

A segunda indica que você reclama de alguma atividade que ainda vai começar e que você sabe que vai te incomodar. Então, você já avisa antes que não vai gostar.

Na primeira você comenta sobre um fato que acontece. Na segunda você comenta sobre um fato que vai acontecer, mas ainda não aconteceu.

Por isso é que a primeira está no PRESENTE do indicativo (é fato que acontece) e a segunda está no FUTURO do subjuntivo (é um fato que pode acontecer, é provável que aconteça mas pode não acontecer).

Na primeira o telefone toca enquanto você trabalha e isso te incomoda; na segunda, SE o telefone tocar, vai te incomodar (mas há uma possibilidade de o telefone não tocar)

O modo subjuntivo trabalha sempre com possibilidades, com hipóteses.

Espero ter ajudado!