дыра и прореха: дыра имеет нейтральный смысл, а прореха - это дыра, которой не должно быть, которая нарушает целостность (например, прореха в обороне)
ожерелье и колье: вообще это одно и тоже, но, колье имеет подвески, то есть это не просто нить с жемчугом.
пагубный и вредный: это синонимы, но более употребимо "вредный" (то, что может навредить), пагубный имеет более негативный смысл (то что может погубить)
cereal - злаки, злаковые