Le "bon de prise en charge" est un document attestant ici que la Sécurité Sociale va payer le produit en question, ici le vaccin contre la grippe. Donc la personne reçoit le produit sans payer elle-même.
Un "bon" est un document permettant d'obtenir quelque chose. C'est le substantif, bien sûr, pas l'adjectif "bon".