» то есть проблемы ли в твоем религие ли в твоем науке "
...то что-то не так или с твоей религией, или с твоей наукой.
Понятие что наука и религия взаимоисключающие фундаментальное учение светского гуманизма.„Понятие что“ можно выкинуть, если это утверждение.
» Оно основано на предположении, что религия основана на принятии желаемого за действительное и слепое повиновение
на принятии ... и слепом повиновении (предложный падеж)
» Наука основана на логике и доказательств
...и доказательствах
Наука через технологии и логика будет решать все проблемы гуманитарных
...будет решать все гуманитарные проблемы (или, допустим, „все проблемы общества“)
» качества жизни, принесенного современной науки.
...принесённого ... наукой.
» чтобы проверить, ли эти утверждения верны или нет.
„ли“ после слова, к которому относится: „верны ли эти утверждения“