what is the difference between
what is the difference between

彼女は留学生じゃありますか？
彼はイエメンの学生じゃありますか？

and

彼女は留学生じゃありませんか？
彼はイエメンの学生じゃありませんか？

Question

what is the difference between
what is the difference between

彼女は留学生じゃありますか？
彼はイエメンの学生じゃありますか？

and

彼女は留学生じゃありませんか？
 彼はイエメンの学生じゃありませんか？

Answer

You don't say 
彼女は留学生じゃありますか？
You say
彼女は留学生ですか？(easiest way to understand), 彼女は留学生じゃないですか？ or 彼女は留学生ではありませんか？