よく勉強していますね 以下私的な見解です、参考程度にどうぞ。 「働きます」は本人の”予定や意思”を表す場合に用いられます。 「働いています」は現実に基づく”状態”を表す場合に用いられます。 つまり、「働きます」は実際に働いていなくても使用する事が出来ますが、 「働いています」は実際に働いていて、初めて使用される表現です。 例文１：　毎日働きますので仕事をください。 　　働きます＝今後毎日働くという意思表明をしています（今現在”働いている”とは言っていない） 例文２：　私は平日旅行へ行く事はできません、なぜなら毎日働いているからです。　 　　働いている（働いています）＝現在（日常）で毎日働いているという事実が表現されています。 例文３：　私は今現在A社で働いていますが、来年からはB社で働きます。 　　A社で働いていますが＝「現在A社で働いている」という状態を表しています。 　　B社で働きます＝今後「B社で働く」という予定、もしくは意思を表しています。

コメント内の質問に対する回答です。 「６時に起きます」と書かれていた場合、 「今日、もしくは明日などの未来に６時に起きる意思がある」 という風に私は受け取ります。　 ただ、「６時に起きます」だけでは”完結した文章でない”ので、 これだけだと意味合いがぼやける事は確かですね。 ＞例えば、「6時に起きます」という習慣がある場合、 ＞「毎日6時に起きています」と言えるのでしょうか。 毎日６時に起きる習慣がある場合は、「６時に起きている」といいます。 「６時に起きる」と言った場合は、「（１度だけ）６時に起きる」事を表します。 I woke up at 6 o'clock at least.　という文章を表す場合は 「６時には起きる」と表現されます。 I woke up at 6 o'clock at least everyday.　の場合は 「毎日６時には起きている」 となります。

補足です。 瞬間動詞の場合、「～ています」を使うと「習慣・反復」または「変化の結果」の意味になります。 （例）毎日6時に起きています。（習慣） 　　　もう起きていますか？ーーはい、起きています。さっき起きました。（変化の結果） 　　　 継続動詞（食べる　とか）なら「習慣・反復」か「動作の現在進行」ですね。 （例） 私は毎日7時に朝ごはんを食べている。（習慣） 電話だよ。－－いま朝ごはんを食べているから、後で！（現在進行） 「～ます」も習慣の意味がありますから、習慣を言うには「～ます」「～ています」の両方使うことができます。ニュアンスの違いはAppleさんのご回答の通りです。（「～ます」のほうが簡単なので、最初にこちらを習いますね。）