差し替える 場所Xがあります。いま、XにAがありますが、Aはだめなので、もっと良いBに差し替えます。 （例） 花を差し替える。（古くなった花を、新しい花に替える） 記事を差し替える。（印刷の前に、間違った/都合が悪い記事を正しい/都合が良い記事に替える） ＊最近も”南方週末社説差し替え事件”がありましたね。 ＊花のように実際に「差す」もののほか、記事、写真、活字、画像などについてよく使われます。 入れ替える 1)場所Xがあります。今、XにAが入っています。Aを取りだして、Bを入れます。 （例） 電池を入れ替える（切れた電池を出して、新しい電池を入れる） ＊「入れる」ものについてよく使います。「電池を差し替える」とは言いません。 ２）場所XとYがあります。今、XにAがあり、YにBがあります。AとBを取って、XにBを、YにAを入れます。 ２'）場所XとYがあります。今、XにAがあり、Yには何もありません。AをXから取って、Yに入れます。 （例） 大阪チームと東京チームの応援席を入れ替える 似た言葉の使い分けを調べるときは類語辞典が便利です。 また、Googleを簡易用例集にして実際の文章をたくさん探し、自分で考えてみるのも勉強になりますよ。 http://dictionary.goo.ne.jp/leaf/thsrs/16444/m0u/%E5%B7%AE%E3%81%97%E6%9B%BF%E3%81%88%E3%82%8B/

基本的に「差し替え」と「入れ替え」は同義語なので、違いはないと考えて大丈夫です。 他にも「取り替え」という同義語があります。 ただ、微妙にニュアンスは違います。 例えば、 花を差し替える 花を入れ替える は両方使いますが、イメージとしては、 花を差し替える＝花の一部またはすべてを別のものと交換する 花を入れ替える＝花すべてを別のものと交換する というニュアンスの違いがある程度でしょうか。 ただ、日本人でもこれらを正確に使い分けることはない（意識されてない）ので、気にしなくても大丈夫だと思います。