Ambos son correctas. En general, usamos la segunda pero depende de la oración o pregunta, usamos la primera. Una cocita, 何が正しいですか。--> どちらが正しいですか。 *Pon el punto japonés, "。" al final de las frases japonesas. Espero que te ayude.

I would choose the second one, sounds more natural to me...

どちらが正しいですか。