Das hat nichts mit dem Wort 'waere' zu tun, sondern damit, dass 'Ihnen' der dritte Fall ist. 'Ihnen' ist das Objekt im Dativ, 'Sie' waere der Nominativ, den man nur beim Subjekt verwendet. Ich bin Ihnen dankbar. Ich bin dir dankbar.

"dankbar sein" verlangt den Dativ, deshalb musst du "ich bin dir/ihm/ihr/euch/ihnen/Ihnen dankbar" schreiben, dasselbe gilt auch für die Konjunktivform: "Ich wäre dir/ihm/ihr/uns/euch/ihnen/Ihnen dankbar." :)

Die Konstruktion ist »jemandem dankbar sein« (analog zu »jemandem danken«), mit dem Dativ.