ellos tuvieron dificultad para entender los idiomas. Since you are talking to some one else you have to start with "ellos"

¡Hola, Nadeen! You can say "Ellos enfrentaron dificultades al entender estos idiomas" Cualquier otra pregunta, no dudes en contactarme. Saludos!

Yo diría: Tuvieron dificultades para entender estos idiomas

ellos enfrentaron dificultades para entender estos idiomas, would be translation word by word, as the verb face, translated to spanish would be enfrentar in this situation. Yet, in order to sound more natural i would just say, tuvieron dificultad(o dificultades) para entender estos idiomas.

Ellos encontraton dificultades en entender estos idiomas.