La segunda opción. "No estoy segura de dónde estaré en marzo." En esta frase estás utilizando el futuro, porque el verbo "estar" se sitúa en el futuro, es decir, en Marzo.
El subjuntivo se usa para expresar deseo o esperanza, consejo o sugerencia. Es una forma verbal complicada.
Espero haberte ayudado :)