Debes tener cuidado al usar TU y USTED. Si inicias la conversación dirigiéndote hacia alguien como ''TU'' toda la conversación se debe desarrollar en esos términos, si intercambias frases dirigiéndose una hacia TU y la siguiente hacia USTED va a sonar muy extraño y es incorrecto.
La corrección es:
Si te diriges hacia la persona como ''TU'': ¿Cómo es tu horario hoy? ¿Estas libre para una conversación en/por Skype? Son las 16:00, hora de Medellin, ¿es una buena hora para ti?
Si te diriges hacia la persona como ''USTED'' ¿Como es su horario hoy? ¿Esta libre para una conversación en/por Skype? Son las 16:00 hora de Medellín, ¿es una buena hora para usted?
Espero que te sirva. Si tienes alguna duda no dudes en decirme ;)