'Non fa niente' means 'it doesn't matter', so the answer is quite weird. A typical answer would be: 'Va bene' which means 'okay'. But: A: Scusami, sono un po' in ritardo. B: Non fa niente.

Nella forma idiomatica : /non fa niente/ = /non importa/ /non fa piu` niente/ = /adesso non importa piu`/ Ovviamente /non fa niente/ puo` avere un significato letterale, non idiomatico: Stiamo tutti lavorando sodo per pescare o preparare il pranzo, tranne Guglielmo che non fa niente, gli piace stare disteso a prendere il sole!