Simple as it is : Ich esse ja einen Apfel! ( normally it would be a suprised reaction but you would not use this because such a situation is really really rare) Ich esse aber einen Apfel! ( if someone asks you why you don't eat something else and you answer " But i am eating an apple!" . For example : You should eat a banana, because it is more healthy! - > But i am eating an apple! (right now) ) Both cases are really rare in a conversation. You can make the sentence sound different if you put "ja" or "aber" in a specific sentence. You will learn that with time in conversations.

Was ist der Unterschied zwischen: Ich esse ja einen Apfel. Ich esse aber keinen Apfel 'ja' und 'aber' sind für Betonung. Man musst die nicht schreiben. Außerdem hören sich die Sätze etwas komisch an, man würde diesen Muster sehr wenig sagen.