Correto o que disse o "Silva D" anteriormente: O que você está fazendo? = Que você está fazendo? As duas frases tem o mesmo significado.
Li em uma gramática da língua portuguesa (autor: Napoleão M. Almeida) que não se deve usar o "O" antes do "que" em perguntas, pois o "O" não tem função nenhuma nessas expressões. O correto seria perguntar "Que você está fazendo?"
Exceção: quando o "que" vem depois do verbo, por questão de eufonia, usa-se corretamente o "o". Ex. Ele está fazendo o quê?
Apesar disso, no Brasil, é muito comum usar-se o "O" antes do "que".
Acho que "O que...?" equivale ao espanhol "El que...?"