Significan exactamente lo mismo, si hubiese una diferencia sería que "en vez de" es un poco mas formal. Si me permites una correccion la haria en la redaccion de tus preguntas: ¿puede ud. decirme si estas frases significan lo mismo o no? ¿cual es la diferencia entre ellas?

Yes, they are the same: En lugar de venir a trabajar, ella se quedó durmiento En vez de venir a trabajar, ella se quedó durmiendo Instead of coming to work, she slept in.