Efectivamente, es tal y como lo has dicho. Cuadrar se puede utilizar para expresar que has entendido algo en un momento específico o que algo encaja de una forma lógica.
- Cuando me lo explicaron, todo cuadró (o "todo encajó")
- Según los acontecimientos, cuadra bastante que el asesino sea el mayordomo
- Cuadrar la caja (cuadrar las finanzas al final del día de, por ejemplo, un bar o un banco)
También se podría utilizar para decir que alguien es muy tozudo o una persona que sigue unas normas muy estrictas:
- Los alemanes son muy cuadrados, siempre siguen las normas a rajatabla
- No seas tan cuadrado, déjate llevar por los sentimientos.