В дополнение к уже сказанному выше. На мой взгляд, у этого выражения есть еще дополнительный оттенок. Используется вещь не просто не подходящая изначально. В данном случае, микроскоп - это довольно высокотехнологичная вещь и использовать его для забивания гвоздей это еще и нерациональное использование ресурсов. То есть, если нет молотка, то, конечно, можно использовать все, что угодно (включая пресловутый микроскоп). Но изначально микроскоп делался с совсем другой целью и такое его использование даже несколько его обесценивает, так как используется лишь малая часть его возможностей. Например, если использовать google только для того, чтобы узнать адрес сайта facebook и больше ничего с его помощью не искать. :)