Es una expresión que normalmente se utiliza para pedir un favor. Puede utilizarse en varios contextos, el principal es cuando prácticamente se ruega a alguien para que nos cumpla un favor, por ejemplo: “¡Tengo que entregar un ensayo y mi laptop se descompuso, por lo que más quieras, préstame la tuya!”. Aunque también podría usarse de manera sarcástica, por ejemplo cuando se le ha pedido a alguien que haga algo múltiples veces y no lo ha realizado: “Ya limpia tu cuarto por lo que más quieras”.
Si te ayuda un poco más a entenderlo, la expresión literalmente significaría algo como: “hazlo por favor, por aquello que más amas”.