Im wissenschaftlichen Sinn gibt es hier, glaube ich, keinen Unterschied aber in der umgangssprachlichen Benutzung schon. Fermentation wird in aller Regel in der gesprochenen deutschen Sprache eher in Zusammenhang mit Nahrungsmitteln, ohne Alkohol, verwendet (Soja, Tee etc.) Von Gärung spricht man meist in Zusammenhang mit Alkohol, also der Herstellung von Wein, Bier etc. Da die beiden Begriffe aber so dicht beieinander liegen und zudem noch das gleiche bedeuten macht es nichts aus, diese beliebig zu verwenden, obwohl umgangssprachlich eher "Gären" benutzt wird.

Keinen Unterschied.