“淨係” 和 “只係”如果表示“只是”時，意思差唔多，不過淨係口語化啲，只係比較正式啲。 另外,“只係”有“只不過”嘅意思嗰陣，好似唔會用“淨係”。 例句： “咁多人裏面，我淨係識得你一個喳!”=“咁多人裏面，我只係識得你一個喳!” “淨係知道”=“只係知道” "我只係你嘅一個普通朋友，唔方便發表意見。" 呢句裏面好似唔會用“淨喺”，因為有“只不過”的意思。 “佢只係講下，唔好當真” “佢只係一條魚，但係竟然想喺天空飛。”

凈係 like：just，只係like：but.（I think the meaning of this word with a turning point）You also can say:只不過。 For example: 凈係：你要噶商品已經賣完，凈係剩低咁多種款式喇。 只係：我明白你噶意思，只係一時之間無咁快反應過來。

基本上意思一樣, 可以混用, 但有時用法會有好微小差別, 如: 我只係想食飯&我淨係想食飯. (一樣) 如: 我淨係鐘意你一個&我只係鐘意你一個. (意思一樣, 但口語時會用的大多是前者)

裏面有講兩個字嘅分別,其實分別唔係咁大,不過都係有些少分別… http://www.cantonese.sheik.co.uk/phorum/read.php?1,130859,130859

我係香港人，兩者係冇分別，我兩者都會講。