Они не дома - не очень естественно звучит по-русски Их нет дома - общеупотребительно. - Малыш, ты один? А где папа с мамой - Их нет дома. И для второго предложения - Где мои лыжи? - Посмотри на чердаке - Я смотрел, в доме их нет. (Ну например, дело происходит на даче, где могут быть другие строения, кроме дома, какой-нибудь гараж или сарай) - Где дети - Наверное в детской - Я смотрел, в доме их нет

Привет. Их нет дома -вариант, используемый чаще всего.

Спасибо.

Первый вариант используется как ответ на вопрос. Второй как утверждение или повествование.