Your sentence has one mistake that was corrected by the previous comments: в твоёМ классе. The same ending of the Prepositional caseб (adjectives and possessive pronouns) can be found in: - она работает в моЁМ офисе - он живёт в своЁМ доме

Он учится в твоём классе. - предложный падеж мужского рода. Твоё - именительный падеж среднего рода. - Это не твоё дело.

Try to remember as much as possible examples of such phrases, for example: в твоёМ классе в твоёМ кармане в твоёМ уме в твоёМ репертуаре в твоёМ пакете etc... Think about it, I'm not professional teacher but none the less it is a matter of habit. You need more practice.(read more Russian books) Good luck, I hope this help.

Правильно - он учится в твоём классе. "Твоём" является определением к слову класс, поэтому должно быть с ним согласовано. "Классе" - единственное число, мужской род, предложный падеж, поэтому и слово "твой" ставим в предложный падеж мужского рода - твоём классе.