Como dice Bárbara, creo que tu segunda frase no es correcta, te envío otra frase casi igual...por si te ayuda: estar a cargo de ...= ser el responsable de algo o de alguien (está a cargo de su hermano pequeño) estar en el cargo de ....= estar en el puesto de ( está en el cargo de Director General...)

Estar a cargo de..... (está bien) Estar en cargo de .... (¿?), esa frase no me suena familiar para nada, de hecho no se me ocurre ninguna oracion. :/