Il semble bon ne se dit pas vraiment. C'est "ça semble bon"
Ça a l'air bon est plus courant, plus simple. Ça a l'air bon, sympa, cool, "tu as l'air fatigué", il a l'air gentil etc.
Sembler est moins courant, plus soutenu dans un sens. Il me semble que...ça semble bon, ça me semble bien etc.
Sinon oui, c'est parfaitement synonyme.