Hola! Para mi criterio no existe error en: "en". Es muy común que se utilice "..."en" la que...", pues, le das sentido a lo que quieres especificar o explicar en la oración, como el caso que señalas. Puedes sustituirlo por: "en el cual" que es más común; además, trata de utilizar los signos de puntuación para darle lógica al contexto. Ejemplo: "En entrenamiento en la negociación, especialmente en el idioma español con la dificultad adicional vía Skype, es una experiencia "en" la cual puedes salir de la zona de confort.".