I would say ビデオコール for "video call" but I think we also say ビデオ電話[でんわ] and テレビ電話. I also say "Can you....?" when I ask if it's possible or not / if we can talk via video call or not.
Do you use video calls on Internet? = インターネットでビデオコールをつかっていますか。
Can you use video calls on Internet? = インターネットでビデオコールができますか。
Do you use Skype? = スカイプを使っていますか。(Can you use Skype? = スカイプが使えますか。)
In casual way, we also say スカイプできる?/ スカイプしてる?/ スカイプ、使ってる?/ etc.
I hope I understood your question well and this was helpful.