La opción correcta y la más indicada para utilizar es ¿Qué tan bien hablas español? En el caso de la segunda pregunta desde mi punto de vista no está bien escrita, la mejor forma de escribirla en caso de usarla sería así: ¿Hablas bien español?. Espero que sea de ayuda mi respuesta

Hola, solo la primera opción es correcta.

¿Qué tan bien hablas español? Es la correcta.

"Tan" means very, something like "muy" for adjectives. De bien = is a meaningless word combination.

"Qué tan bien hablas español?" Esta pregunta es común utilizarla. "Cómo de bien hablas español?" Esta frase es incorrecta, no se dice así. What you could do with the last phrase, is separating it in two, you could ask: "Cómo hablas el español? Lo hablas bien?" and this would sound normal and it's correct.