Pour ce qui est de la différence entre "dans" et "au bout de," c'est vrai qu'on parle de la fin d'un processus. Le mot "aboutir" par exemple me vient à l'esprit ... Avec l'expression "au bout de" on parle d'une durée de temps, d'un processus, d'une démarche qui va "aboutir" à quelque chose. Donc "Au bout de dix ans d'études j'aurai finalement terminé ma vie d'étudiant !" En revanche, le sens du mot "dans" est relatif par rapport aux circonstances de l'énoncé, "Dans trois minutes on va partir" => "D'ici trois minutes on sera partis." Du coup votre deuxième proposition me paraît bizarre, on dirait presque que l'étudiante prévoit une pause de deux ans, et qu'à la fin de sa pause elle compte se relancer dans ses études.

En reprenant tes exemples : Dans => A la fin de la période donnée Au bout de => Assez peu utilisé, et dans la phrase mise en exemple, on écrirait plutôt "2) Après avoir eu ma licence, je ferai un master pendant deux ans" En => Durant la période donnée Après, ces mots sont comme dans bien des langues utilisés pour des raisons différentes. Dur de donner une généralité. Par exemple : Dans = A l'intérieur, dans une période (a la fin) Au bout = A la fin Pendant = Durant En = Durant, pour indiquer une matière, un pays,...

Bonne chance