Me parece que falta un pequeño detalle:
Lo hice por su bien, pero es como si me hubiera equivocado.
Al agregar "es", se relacionan ambas partes de la oración.Y la coma ",".
28 กันยายน 2013
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Sí, también puedes decir "Lo hice por su bien pero como si me equivocara..." o "Lo hice por su bien pero como si me hubiese equivocado..."