Yes, definitely they have the same meaning. We can use both form, and we'll be understood in both countries. Only it is more common: infinitive in Portugal and gerund in Brazil.

E ai Harry, Tudo Bem? No Brasil é: Estou trabalhando. Em Portugal: Estou a trabalhar. Realmente é apenas diferença do português dos dois países. Mas falando de qualquer jeito você será entendido. How are you Harry? All ok? In Brazil is: Estou trabalhando. At Portugual is: Estou a trabalhar. Really this difference is only between portuguese of the two countrys. But speaking anyway you will be undertoodd.

No Brasil a forma, Estou trabalhando, está correta. A frase obedece a seguinte regra:atua como verbo nas locuções verbais e orações reduzidas, indicando um processo em curso ou prolongado: Sugiro a leitura do artigo: http://brasilescola.uol.com.br/gramatica/gerundio.htm

Em Portugal é muito mais comum a construção "estar a + infinito", embora haja regiões (Alentejo) onde também é comum a construção "estar + gerúndio". https://ciberduvidas.iscte-iul.pt/artigos/rubricas/lusofonias/o-gerundio/1416