1) Me extrañó que él no quería venir con nosotros.
Me extrañó que él no quisiera venir con nosotros.
La verdad que, entre estas dos frases la diferencia es muy sutil y pueden ser las dos válidas aunque, yo utilizaría la segunda. Es más correcta.
2) ¿Crees que él ganará las próximas elecciones?
Aquí claramente la respuesta correcta es esta. Porque preguntando de esa manera estas hablando sobre el futuro, entonces el verbo tiene que ir en futuro, y no en pasado como la otra frase.
3) Si tuvieras la oportunidad de empezar de cero, ¿te volverías a casar?
Si hubieras tenido la oportunidad de empezar de cero, ¿te volverías a casar?
Aquí cada frase tiene un significado diferente. Me explico
-Si tuvieras... Esta frases se refiere al presente. Es decir, si tuvieses la oportunidad AHORA, ¿qué harias?
- SI hubieras tenido... Esta frase se refiere al pasado, es decir, si esa oportunidad se hubiese presentado hace una semana (por ejemplo) o en definitiva en cualquier situación pasada, ¿qué habrías hecho?