Beide sind gut. "Er fährt U-Bahn". Im Allgemeinen wird dann gemeint dass derjenige ein notorischer U-Bahn Fahrer ist oder lieber mit der U-Bahn fährt. Wie man z.B. sagt "Er fährt BMW". "Er fährt mit der U-Bahn". Wenn es mehr Möglichkeiten gibt und derjenige wählt in diesem Fall die U-Bahn. Vielen dank! -R.