你学中文学了多久了？ 你学中文多久了？ 你学中文多久了？ 最自然 你中文学了多久了？ 可以改成 你中文学多久了？/你中文学了多久？ 你学了多久的中文了？ 你学了多久的中文？ 在中文里面，有一个了字往往比多个了字更自然。

你学中文学了多久了？= 你学中文多久了？= 你中文学了多久了？= 你中文学多久了？ = 你的中文学了多久了？ = 你学了多久的中文了？= 中文，你学多久了？ They are all okay. I don't know which is the most natural. But I would use '你(的)中文学多久了'.

都一样， 最短的句子当然最口语化，也是最自然的。

你学中文多久了？ （比较口语）

除了最后一句差一些，第一句略啰嗦一些，其余都好。不存在你说的最自然，有时人们会故意说的啰嗦一些，因为说话除了表达意思之外，还有语言之外的东西。