Ciao Yana,
In queste frasi è più corretto usare il trapassato prossimo perchè parliamo di un passato nel passato, ad accezione della frase 1 perché c'è l'avverbio di tempo "prima".
Quindi:
1.
-Prima ha detto che è stato al cinema... (e poi da sua madre)
-Prima ha detto che era stato al cinema.
2. Ha chiesto dove era stato.
3. Ha detto che quel giorno non l'aveva visto